秦始皇三十三年（公元前214年）秦兵征服岭南后，在岭南地区设置南海、桂林、象3个郡（今市境属象郡），在对岭南特别是对骆越地区的管理上采取羁縻政策，允许越人“骆将统治”，保留骆越风俗，“以其故俗治”，实行自治。

　　秦灭亡后，赵陀在岭南建立南越国。南越国继续维持原有羁縻政策，允许越人自治。西汉元鼎六年（前111年）武帝平定南越国和瓯雒国后，废除西于王，设置西于县（今防城港市境属西于县），对骆越地区仍然保留羁縻管理政策。

　　东汉初建武十八年（42年），伏波将军马援平定交趾征侧、征贰姐妹叛乱后，骆越地区完全恢复羁縻管理政策。同时，在当时交趾郡的东北以及合浦郡西部（包括现在防城、东兴、港口等地区）设置如昔、时罗、时休、贴浪、澌凛、古森、思勒、丫葛（又称河洲）、罗浮9峒，由黄万定后裔任世袭峒主（峒长），开启防城港境域的土司管理制度。土司峒主由王朝任命，掌握着地方军政大权，实行世袭制度并高度自治，只需要臣服于中央朝廷，基本上不用纳税，只是象征性缴纳少量土特产，朝廷基本上不会干涉土司的政事。

　　东汉后，朝廷一直想在今上思一带推行羁縻管理政策。唐天宝初年，朝廷在今上思地设置羁縻上思州，由土酋进行高度自治，上思羁縻管理制度进入鼎盛时期。

　　从东汉建武十九年(43年)黄万定留守戍边开始，他的子孙一直世袭土司，直到明洪武二年（1369年）改土归流开启，共延绵了一千三百多年的历史。在这个时段，防城港境域8峒（宋开宝五年时休峒并入时罗峒）的辖地先后曾经设置有黄州、峰州、陆州、玉山州、南亭州和西于县、封谷县、安平县、安海县、海平县、宁海县、玉山县、华清县、内亭县、遵化县等州县，朝廷也派有州县官治理。但是，除黄氏州县长官之外，史书只记载有唐朝长庆年间陆州刺史葛维一个人的任职历史，而葛维最终也被黄姓土司所杀。由此可以推测，今防城港境内8峒辖区的州县长官要么是由黄氏土司兼任，要么即使朝廷派人充任但实权却掌握在土司手里，峒内则实行土司自治。

　　宋皇祐年间平定侬智高叛乱后，骆越地区全面推行土司管理制度，防城港境内7峒（如昔峒设镇将不设峒主）峒主升为长官司，并由朝廷授予铜印，执掌军政大权并可以世袭。同一时期，上思羁縻州改为上思土州，在上思州西部又设置迁隆土州，两个州由随狄青平定侬智高的黄氏部将留任土司并实行世袭制度。

　　宋朝初期，交趾立国，防城港境内与交趾国接壤的地区形势非常复杂，朝廷对当时7峒的土司统治开始不放心。到明朝后，朝廷便开始对土司管理的7峒实施改土归流，对当地实行的羁縻和土司自治管理制度进行改革，借此来削弱土司势力，增强流官对该地的控制。从明洪武二年（1369年）开始，在如昔峒设置如昔巡检司（治所是如昔都，在今东兴江平镇），并派流官治理8峒地区。同时没收7峒长官司的铜印，并改授思勒峒长官司为千户武官，改授罗浮峒长官司为百户武官，其他5峒长官司改授峒长，各峒土司的管理权力实际上都被削减了。

　　改土归流引发了7峒土司的不满。明宣德二年（1427年），澌凛峒峒长黄金广、罗浮峒峒长黄子娇、古森峒峒长黄命祚、丫葛峒峒长黄建4人利用调动峒兵和弓兵协防丫葛关的机会，联合思勒峒、佛淘径巡检司所管辖的19村（另有99村之说）涉及幅员200余里地域272户居民叛投安南，时罗峒峒长黄德志也带领2400多人随黄金广等人一起叛投。黄金广、黄子娇等叛投后，安南国将他们原来的辖地划属安南万宁州，并把万宁州的州治迁到如昔（今江平)，仍然让叛投安南的黄氏土司世袭守护这部分地域。此后，朝廷曾多次诏命地方官员揭榜招安叛民，但都未能如愿。明嘉靖二十一年（1542年），由钦州知州林希元亲自招请，反叛安南的居民才愿意回还。从黄金广他们当初叛逃到被招安回归，时间上已经过去了115年。回归后，7峒的峒长仍然由原黄氏土司世袭。

　　明弘治十八年（1505年）起，上思境域也开始实施改土归流，废除了当地的土司，任流官来主管州政事务。黄氏土司对改土归流的实施也是极端的不满，因此多次起兵叛乱，一心想恢复土司管理制度。嘉靖三十一年（1552年），上思土司叛乱被彻底平定，上思土司势力基本被消除，当地开始由流官主政，虽然当时迁隆峒还保留峒名和峒官，但峒官基本上已经没有实权。

　　清乾隆四年（1739年），龙门巡检司移驻防城并更名为防城巡检司。此时，8峒原来所管辖的地域都由如昔、防城两巡检司管辖，地方政权由两巡检司流官掌握。光绪十四年（1888年）防城设县后，8峒辖地由防城知县主政。清朝末年，防城土司制度已被完全废除，但属于上思县辖地的迁隆峒直到民国16年（1927年）才被正式废除。至此，今防城港市境的土司全部彻底废止，作为曾经在防城港境域实行了一千多年的土司制度成了历史的记忆。